1945年南京火车站,程慈航看到拎着神秘箱子的小野后马上追上去，警察厅长莫采石下令一定要抢到箱子,就在程慈航快制伏小野时，警察欧阳倩和关天平赶到，小野逃跑，箱子被莫采石拿走。莫采石将箱子存进中央博物院...
经过勘察，程慈航告诉欧阳倩窃贼就住在附近的铁矿区。刘阿常向严达庆汇报，窃贼是江湖大盗许老二。程慈航、严达庆均赶到许老二的住处，许老二逃跑，他的一名徒弟没能成功脱逃，情急之下抓住了路边的一个姑娘霍蜜儿。...
莫采石希望程慈航不要插手五九档案的事，但程慈航想通过此案找到中田，为小玉报仇。入夜，莫采石接到电话说肖主任夫妇被杀，哈金斯上校拜访莫采石，希望中国政府能尽快找到五九档案，并提出让程慈航出山。霍然给程慈...
程慈航正式入驻警厅办案，欧阳倩等人被严达庆指派为他的助手。程慈航和欧阳倩去紫金乐器行找破案线索，在小提琴厂找到了犯罪嫌疑人李大壮的衣服和财物，但当他们来到李大壮的住处时，李大壮已因吸食鸦片过度身亡。严...
严达庆和霍然急于结案，程慈航不同意，再次勘察现场，得出结论，凶手共有两个人，李大壮的同伙就住在附近。程慈航带着众警察来到发现李大壮尸体的地方，查到了一个可疑的人——皮三。程慈航和欧阳倩辗转找到皮三，程...
欧阳倩带来一张刘勇的画像，让李丽兰帮忙找人。李丽兰查到刘勇经常去的一家茶馆，程慈航和欧阳倩守候在茶馆附近，刘勇出现了，严达庆也带了一群人赶到。刘勇跑进茶馆劫持了一个姑娘，刘阿常从暗处放枪，将刘勇打死。...
程慈航和欧阳倩去许老二家查案,马副官告诫刘阿常事情要处理得干干净净。刘阿常开枪射杀了许老二，断指躲在树丛中被发现,刘阿常正要杀他灭口，一个黑衣人出现，刘阿常杀了黑衣人，断指逃跑。程慈航觉得刘阿常身上疑...
程慈航送给欧阳倩一支玫瑰，被中田的密探捕捉到，中田心生一计，逮捕了欧阳倩，让程慈航拿五九档案来换。程慈航虽一路被蒙住双眼，但他凭超强的记忆和敏锐的洞察力找到了欧阳倩被禁闭的处所，趁中田外出之时将其救出...
在哈金斯的引导下，程慈航开始留意锦线的踪迹。李丽兰私自冒充马太太去见哈金斯，被程慈航盯上。刘振亮向哈金斯拆穿李丽兰的伎俩，哈金斯颇为失望，觉得锦线不像他心中所想的那么讲义气。欧阳倩发现刘振亮有鬼，故意...
霍蜜儿看出欧阳倩和程慈航之间关系不浅，但她毫不退缩。晚上，程慈航和欧阳倩参加舞会，霍蜜儿又来搅和，她拉着程慈航跳舞，但程慈航的心思都在欧阳倩身上。霍蜜儿深夜回家，严达庆看到她被程慈航迷住，勃然大怒。刘...
程慈航救了被江湖人士追杀的刘振亮，俩人一起找五九档案。刘猛向严达庆告密程慈航和刘振亮在一起，严达庆带人捉拿二人。程慈航掩护刘振亮逃跑，严达庆借题发挥，打伤了程慈航，莫采石训斥严达庆。外国使馆接连被盗，...
李丽兰假扮女佣到莫采石家找五九档案，无意中碰倒笔架，莫采石上楼，并未发现任何人的踪迹。程慈航上楼后闻到了李丽兰残留的香水味，断定李丽兰是窃贼，他怀疑窃贼跟锦线有关，向欧阳倩求证李丽兰和她是何关系，并责...
马副官悄悄将五九档案放进程慈航新住处的座钟里，莫采石告诉程慈航座钟是其亲生父亲的遗物，让他好好保留，程慈航很是感激。李丽兰告诉欧阳倩，马太太回来了，马太太批评李丽兰不该私下接触美国人，锦线不要随便得罪...
程慈航分析案情，推断作案者是锦线的叛徒，而欧阳倩则把线索指向了燕子飞。刘阿常向马副官介绍燕子飞的情况，马副官认为此人不能落在程慈航手里，建议刘阿常向严达庆邀功，给程慈航搅局。燕子飞控制住欧阳倩，打算痛...
断指到警察厅找莫采石，想告诉他自己手中握有五九档案，被马副官拦截下，不明真相的断指误信了马副官，将自己知道的都告诉了他。马副官暗中派人去杀断指，结果扑空。欧阳倩拜访乔迁新居的程慈航，霍蜜儿兴冲冲地跑来...
程慈航画出断指的肖像，希望找到这个举报者。程慈航询问马副官举报者情况，马副官含糊其辞称此人是骗子。断指打电话找程慈航，严达庆冒充程慈航，断指发现严达庆抓自己，误以为是程慈航派来的，对程慈航的信任就此打...
外交部费次长家、教育部长家、霍然家接二连三被盗，莫采石勒令程慈航火速破案。原来李丽兰和哈金斯合作，在寻找五九档案。程慈航判断是锦线高人，哈金斯不承认自己是霍总长家盗窃案的主谋。严达庆对燕子飞刑讯逼供，...
程慈航根据描述画出了嫌犯的长相，正是李丽兰，欧阳倩让李丽兰赶快离开南京躲避。程慈航安排刘猛在李丽兰所住的酒店大堂潜伏，刘猛发现李丽兰准备离开南京，程慈航赶到码头时，李丽兰已经检票上船。程慈航让关天平凭...
程慈航请老刘配合，从海关缉私队手上带走了李丽兰，但审讯没有任何进展，于是他带着酒菜和李丽兰喝酒，将其灌醉后让人搜身，果然发现腋下藏着提货单。欧阳倩回到锦线，齐掌柜告诉她戚师伯回来了，戚承祖找到老战友莫...
程慈航担心欧阳倩很有可能和锦线有关联，欧阳倩也从戚承祖口中得知自己和程慈航都是细菌战的孤儿，都曾被锦线收养。马歇尔出访南京，莫采石和霍然对安保工作深感压力，中田和宫本得知后，希望从马歇尔身上找到五九档...
霍蜜儿在莫采石家大倒苦水，说自己千辛万苦搞到的名单被程慈航转手给了欧阳倩。程慈航给警察厅打电话，留言让欧阳倩去南宝塔根找断指。刘振亮混入国际饭店展开行动，胁迫服务员搞到了钥匙。哈金斯赴约回来，敲门却无...
断指将铁盒找了个偏僻处埋下，正好被老叫花看到，老叫花掘出铁盒卖到江湖上。欧阳倩告诉齐掌柜，必须赶在程慈航之前找到断指，这样才能找到五九档案。齐掌柜安排锦线弟子抓住断指，程慈航怀疑欧阳倩和断指被抓有关，...
哈金斯得知锦线抓到的断指正是五九档案失窃案的线索，懊悔不已，决定出面阻止锦线将断指交给莫采石。警察厅的案情分析会上，程慈航认为杀害断指的人就是盗窃五九档案的人，而凶手正是马副官。莫采石下发通缉令抓捕马...
马副官决定不再拖累莫采石，选择了自杀。霍然宣布失窃案彻底侦破，请程慈航务必参加庆功会。失窃案告破，程慈航故意宣布已经找到五九档案，又上了报。霍蜜儿帮助程慈航去青铜馆进行调查，得到当时失窃的保安记录。马...
程慈航坚持去查苏州的线索，为了拖延和干扰他，莫采石采取了拙劣的手段，故意在各地放出五九档案的消息，混淆视听。马歇尔的专车不翼而飞，莫采石和霍然严令严达庆限期破案。霍然想到程慈航，让芜湖警方紧急将他叫回...
程慈航得到线索，画出了盗车者的肖像，此人正是刘振亮。马太太愿意就擒，请程慈航不要为难其他人，她还告诉程慈航，锦线对五九档案的争夺目的是为了让日本的侵略罪行公布于天下。程慈航劝告马太太约束弟子，尽快离开...
刘振亮和小飞躲藏在废弃的妓院里，程慈航带众人将他们包围，刘阿常带队进入，程慈航在后窗堵截。刘振亮带着小飞从后窗跳出，程慈航紧追他们来到河边，一枪击中刘振亮，刘振亮坠河。随后赶到的严达庆看到程慈航的背影...
霍蜜儿怒闯警察厅，在办公室枪击严达庆要为程慈航报仇，幸亏欧阳倩及时赶到，才阻止了事态恶化。莫采石训斥严达庆，想通过霍然之手把程慈航调离警察厅，让他远离五九档案。刘振亮在戚玉芳的照料下病情有所好转，渐渐...
霍蜜儿发现莫采石送给程慈航的钟坏了，擅自送到钟表行去修理。钟表行老板在钟的底座发现了五九档案，暗中将档案卖给了小野。莫采石发现真的五九档案不翼而飞,大惊失色。欧阳倩告诉李丽兰日本人拿到了五九档案，想借...
莫采石得知程慈航偷偷去常熟查案，担心他掉进自己的布局，连忙派人拦截。程慈航在路上成功破解了莫采石设的障碍，顺利抵达常熟。陈如骏和美晴在屋内偷情，突然听到敲门声，俩人顿时紧张起来，开门一看却见是马太太。...
马太太拦截下青丸号，众人打开匣子一看却是一份假的五九档案，原来真的已被莫采石换走。程慈航和霍蜜儿在酒店等欧阳倩回来，不料等到的却是方捷和欧阳倩。欧阳倩告诉程慈航，方捷才是她真正的男朋友，程慈航不相信这...
严达庆向莫采石汇报锦线堂口遇袭，江湖传言五九档案在锦线手中，程慈航申请全力追剿锦线。五九档案重现江湖，马太太决定重金去买。程慈航说要在找到五九档案之前将锦线中人控制起来，免遭江湖黑手的杀戮。欧阳倩劝他...
莫采石劝程慈航忘掉欧阳倩，娶霍蜜儿。戚承祖找到警局，劝程慈航回归锦线主持大局，程慈航拒绝。戚承祖再次找到程慈航，告知他是锦线收养的孩子，为了更好的前途才托付给莫采石收养，程慈航答应不再为难锦线。莫采石...
刘振亮杀死小芳，想要带着铁匣子逃跑，恰巧遇到戚承祖回来，打斗过程中，戚承祖被刘振亮杀死。欧阳倩强忍悲痛，和程慈航勘察江流湾凶杀案现场。程慈航发现了刘振亮有弹孔的皮夹克，发誓一定会找到真凶为戚师伯报仇。...
宫本将众人引到警察厅门口，引来警察抓住日本特务，自己趁乱逃脱。小野被中田斥责，宫本上了中田的必死黑名单。马太太正式任命欧阳倩为掌门人，希望她找到五九档案，并删除程慈航在锦线的所有记录，之后便溘然长逝。...
程慈航去质问严达庆，莫采石警告程慈航警局暗流丛生，不要瞎掺和。莫采石正式提出要给程慈航和霍蜜儿订婚，严达庆暗中决定铲除程慈航，从欧阳倩入手。关天平接受欧阳倩的委托，保存自己以前的相册。严达庆借机搜查程...
李丽兰为欧阳倩抱不平，坚持要找程慈航算账，寻找机会将其捆走。程慈航被锦线的人押到马太太墓前，李丽兰责备程慈航气死马太太，害死了戚承祖。欧阳倩拦下李丽兰，李丽兰告诉程慈航欧阳倩的难处和所做的牺牲。程慈航...
程慈航救下一个被小流氓调戏的外国女大学生，名字叫卡佳。卡佳和程慈航接近的画面被拍下来，照片被送到霍然面前。霍然给霍蜜儿看了照片，希望霍蜜儿死心。锦线发现戚承祖死前写的一封信提到了杨展，又搜出芜湖女子毛...
程慈航向霍蜜儿求婚，俩人领了结婚证。刘振亮和毛红萼在餐厅吃饭，程慈航带人抓捕了刘振亮，欧阳倩找程慈航问刘振亮的下落，程慈航闭口不谈。刘振亮在被送往行刑的路上被锦线所劫，齐掌柜处死了刘振亮，欧阳倩派人将...
程慈航得知铁匣子被刘振亮藏在毛公馆内的保险箱里，便和欧阳倩一起前去寻找，不料已被严达庆抢先一步拿走，二人一路追踪，枪战中，欧阳倩为掩护程慈航被严达庆的黑枪打中毙命，悲愤的程慈航打死了严达庆。警察厅里，...
莫采石夜不能寐，打开屋内的保险柜，五九档案就在柜中。程慈航请刘阿常帮忙打听是谁把严达庆安排到茅山监狱工作，为了防止刘阿常泄露更多秘密，莫采石派人暗杀他，刘阿常侥幸躲过一劫，来到莫采石处领罪，莫采石让他...
程慈航无意中发现莫采石送给他的钟并不是父亲的遗物，底部是空的，意识到莫采石一直在欺骗他。程慈航通过在藏经楼和中央博物院发现的漆皮推测，五九档案就在藏经楼的藏经室里。关天平向程慈航坦诚自己是共产党员，恳...
程慈航以民族大义劝说莫采石帮自己拿到五九档案，莫采石将中正剑交给他。灵谷寺藏经楼，程慈航穿着军装、拿着中正剑取走了五九档案。霍蜜儿控制住父亲，也匆匆赶往藏经楼，程慈航遭到中田等人的伏击，霍蜜儿为了保护...
