天心参加院士考试，却差点把监考官气的窒息。眼看监考官就要一命呜呼，天心当机立断，折断毛笔，在众目睽睽之下，一把将笔管插进监考官的喉头…天心虽然救了考官，却因为救人手法太过于惊世骇俗，被轰出了太医院！首...
哲三在缠斗中受了重伤，逃进了阉割房。虽然过追捕，但却又阴错阳差、被当成未净身的准太监，在受伤无力抵抗下、被五花大绑上了手术台。但没想到执刀的张师父因为伤风向天心求诊，忘了吃药不能喝酒。张师父头昏眼花、...
朱历硬着头皮陪表妹放风筝。云莺对朱历示好，朱历多次想要逃跑不成，于是扯断风筝线，飞到太医院围墙边的树上！嘿嘿、风筝没了，这下可解脱了。但没想到云莺仗着太后撑腰、硬是要皇上上去捡风筝。朱历想要救出哲三天...
行刑当日，天心、哲三还不见朱历来搭救，心想大势已去，忽然这时李保川接到了封信，马上下令，放了天心、哲三两人。忽然朱历、哲三同时醒来，原来刚刚是装醉，朱历跟哲三找出黄金瓮后，向哲三献计，要飞贼哲三故意暴...
保川要天心治疗太后的厌食症，如果治不好，就砍了天心的脑袋。但其实太后根本没病，只是缺乏运动而已。天心三人一出宫，发现附近酒楼传来吵闹声。原来是湘凝在酒楼吃饭，但是钱不小心被扒了，付不出钱，于是跟店家起...
大娘提醒天心，最近因为选妃，没事情就别回来了。原来天心的户卡上记的还是女儿，这时湘凝、哲三吵了起来。哲三故意激讽湘凝。湘凝气不过，砸的天心家乱七八糟，遭来一顿斥骂，湘凝觉得没面子，负气离开。天心喝令哲...
天心一回宫，发现选进宫里的佳丽全是些拐瓜裂枣的恐龙妹。而湘凝也进了宫来。云莺觉得湘凝是最大的敌人，一看见她就不顺眼，马上就跟李保川密谋，准备除去湘凝这个最大的敌人。朱历来找天心，正巧天心要换回男装，虽...
保川为了让云莺中选，偷偷塞了包春药给云莺，还暗示云莺，若是云莺先怀了龙种，管他湘凝是甚么来头，皇后一位，非云莺莫属。云莺下药成功。频频对皇上搔首弄姿，还趁势想脱朱历衣服，虽然朱历巧妙躲过，但还是不敌云...
太后限定的期限已到，太后抓来天心，问天心要怎么治好朱历的病，天心说不出来，太后下令马上砍了天心，就在这个时候，太后接到消息，朱历的病已经好了，选妃如期举行。保川忽然将天心约来，同桌吃饭，说天心替他除去...
天心却为了发现朱历的真实身分狂冒冷汗。所谓太岁头上动土莫过于此，天心想到自己过去老对着朱历大骂皇上，而且，还差点被皇上临幸！在天心的小脑袋里，对朱历的心动，好像越来越复杂了。天心对朱历说道，他已经知道...
一行人回京后，朱历马上当着文武百官的面宣布要成立廉政院，并令哲三为御史，引起甫嵩等人不满。朱历还将当初被保川关入大牢的东厂官兵放了出来，让哲三调度。朱历、哲三展开了反贪任务。而他们的第一个目标，挑了平...
甫嵩接获消息，皇上、哲三带着大批人马前来，甫嵩情急之下将账本交给了湘凝。天心躲了起来没被甫嵩发现，但湘凝手上那本账册，让天心不禁怀疑、担心了起来…皇上、哲三带着大批人马前去搜查账册，但赵甫嵩说自己光明...
李保川得知消息后，心里十分开心。跑去太后面前嚼舌根，说何家不识抬举，居然连太后的赐婚都敢违抗，不但无视皇族威严，甚至不将太后这个主婚人放在眼里。还建议太后派人监视何天，不然何天到时若是跑了，太后的面子...
大娘被抓了，天心在小石头的帮忙下，放了风筝找来朱历，想要见大娘一面，却不小心被李保川发现。天心在哲三的掩护下，原本可以逃跑，但天心为了救大娘，决定娶湘凝为妻。不懂天心为什么逃婚，湘凝前来对天心兴师问罪...
原来这是朱历和哲三想出来救天心的方法，为了取信李保川，朱历甚至要求哲三在自己身上划一刀。李保川坚持不肯退兵，此时大娘突然驾着马车出现，将朱历哲三、天心三人带上车就走，李保川气得说不出话来。朱历命哲三好...
天心好不容易得到哲三从宫里带回朱历的回信，信上却充满了不要天心担心、粉饰太平的言语，和哲三说的实情完全不同。天心毅然决然离开山上，要去宫里找朱历，全没发现哲三跟大娘也悄悄尾随自己出来。苡柔故意讨好天心...
苡柔为了尽速实现当上皇后的愿望，不惜发毒誓拜李保川为干爹。为了取信天心、朱历，还掩护天心逃过李保川的搜查。但天心知道了朱历的为难，自动选择离开，哲三现身，带天心回到山上。太后知道了帮自己治病的人是天心...
苡柔亲切的带着大娘、天心参观。大家正高兴之时，云莺却突然出现，一直喜欢朱历的她，认为天心是玩弄朱历感情的大骗子，一定只是想在宫里为非作歹，所以气冲冲跑来找天心，不但迎头就打天心一巴掌，更把大娘赶出宫去...
天心要龄春去太医院帮苡柔抓药，苡柔乘机对天心打听他的身世，得知天心的父亲早就离开他们了，而天心的针灸手艺，全是靠自学来的。另外保川得知天心在找「本草品汇经要」一书，保川要苡柔加把劲，问出天心为何要找此...
云莺一死，天心怀疑是不是哲三替他出气而痛下杀手，哲三证明自己没有杀云莺的动机，此时朱历带来消息，说云莺的案情有重大发展，但凶手的指向，是天心。当下要天心先行逃亡。天心坚持不肯逃亡，要朱历为自己证明清白...
朱历倍感压力，苡柔这时给朱历假的侦办方向，将目标指向选妃。朱历、哲三认为甫嵩之前在选妃的时候涉有重大嫌疑，两人决定先将天心救离开刑部，再继续调查。朱历、哲三兵分两路，一边去保川那边搜查毒药的来源。另外...
正在庙里替天心祈福的大娘，忽然收到天心要被送去法场的消息。天心、大娘在押解过程一阵生离死别，大娘不愿意天心就此送命，当下不顾老陶的阻挡，冲去法场要解救天心。另一方面，朱历在最后一刻才接到天心要被问斩的...
朱历向太后禀告侦办结果，太后得知原来云莺跟华妥是蓄意要害天心。当下要朱历对外隐瞒实情，并且打赏天心，以示补偿。朱历发现华妥之死的种种疑点，跟苡柔讨论着。朱历察觉这事情或许不单纯，背后可能有庞大的集团在...
哲三为了报复湘凝，将湘凝抓起来关在男澡堂内，但没想到湘凝就这样不见了，哲三到处找不到湘凝，最后却被湘凝一把推古井，而哲三以身子护着湘凝，自己却摔断了腿。朱历被蒙在鼓里的天心，引来更大的误会，朱历觉得天...
湘凝为了救哲三，前去药铺抢药。并且不离不弃的照顾哲三，但不懂医术的湘凝，只能眼睁睁的看着哲三的伤势越来越严重，却又无可奈何。天心问起龄春，当时布娃娃有没有被人拿走，龄春心地善良，天心也觉得龄春不像是会...
朱历为了证明自己对天心的情意，决定也要立天心为妃，没想到天心居然拒绝，并且希望朱历专心一意的对待苡柔，并告诉朱历，他跟朱历从此之后，就只能是兄妹。大娘害怕哲三藏身地被发现，将哲三移去其它安全的地方。但...
太后经过冷泉的治疗，脱离了险境。太后叫来哲三，问起哲三为什么躲入宫中，假冒太监。哲三如实道来，并坦承是因为认识了朱历、天心这两个好朋友，所以才不愿意离开皇宫。太后欣赏他的以德报怨，坦率直言，有心想要原...
保川对苡柔说道，他在后宫待了三十年，看了多少妃嫔被冷落。提醒苡柔还是得小心天心。而苡柔对朱历撒谎说天心在储秀合学习状态良好，骗取朱历来储秀阁，一方面又对天心说宫中有罕见的禁药黑玉香，让天心主动开口对朱...
天心无法对外求援，于是打算用针灸舒缓黑玉香的毒性，但针灸都被翠环、苡柔没收，天心对于苡柔他的虐待，毫无招架之力。哲三回家后，发现湘凝出现在他家里，并且替他整理环境、打理生活。哲三不解风情，不懂湘凝好意...
朱历找来哲三，对哲三说天心染上药瘾的事情。哲三不但不相信，还把罪过怪在朱历身上。哲三决定自己求证天心是不是真的染上药瘾，并且许诺，绝不会给朱历带来任何麻烦。哲三就在湘凝的帮忙下，偷偷潜入储秀阁。发现了...
朱历前来找天心，希望天心跟他一起回宫。又因此跟哲三吵了起来，天心制止朱历、哲三，答应回宫。不过条件是让他回太医院继续当院士，再也不理后宫的事情。而天心不知道，让他回宫，是朱历答应太后，从此之后每天呆在...
天心、哲三两人回去找大娘，两人一搭一唱想要从大娘那边套出些话来，没想到大娘守口如瓶，而且居然说要是天心以后在从他面前提到这个名字，从此断绝母女关系。藏书阁的老太监向保川告密，说何天心借走一套书，保川发...
保川拿着追捕天心时，他们掉下来的九针别诀来找朱历，要朱历下令，完成先皇遗愿，缉拿天心、大娘到案。朱历无奈之下，只准保川、甫嵩捉拿他们到案，但不得伤他们半根汗毛。但保川、甫嵩却假传圣旨，不但要手下监视京...
保川要苡柔去探听朱历、天心究竟在搞什么鬼。苡柔推辞，保川便以知道苡柔是假怀孕为由，要挟苡柔。还要翠环私底下监视苡柔，苡柔表面上顺从，实际上，已经在盘算反扑保川的计谋。哲三前去探望湘凝，他发现湘凝的改变...
大娘将本草一书交给了朱历，并且拜托朱历一定要救天心。过程中，朱历无意间发现，本草的序文跟字卡品凑起来，居然露出勿信皇上亡于常命几个字。哲三只身来到太师府，打算替小石头报仇，湘凝为了保护父亲，不小心被哲...
本草一书已经确认编撰无误之后，湘凝的伤势也渐渐康复，但朱历为了天心的安全，依然不准天心离开医护站，朱历怕天心闷得慌，特别叫龄春来跟天心作伴。龄春一来，便跟天心说起这段日子他所受的委屈，但是他忍辱负重，...
虽然天心被层层戒护，但翠环的计谋依旧成功。眼看天心就要被下毒而死，龄春情急之下用嘴吸出天心的毒血，自己却不小心中毒。而龄春临死前，跟天心说道，云莺死的时候，他其实看见苡柔从医护站出来。朱历跟苡柔谈及龄...
李保川一死、朱历便从冷泉那得知、原来苡柔并没有怀孕。而苡柔也被朱历发现他想对天心下毒，就此将苡柔软禁在储秀阁。太后头疼又犯了、但是天心这次怎么治都治不好、天心在本草上发现几帖药、加上黑玉香、可以制成一...
